Pesquisador de Iniciação Científica Luan Dopke apresentou seu artigo no dia 15 de abril  na XXI ERAD/RS.

Organizada pela Universidade do Estado de Santa Catarina (UDESC), a 21ª edição da ERAD/RS (Escola Regional de Alto Desempenho da Região Sul) ocorreu no mês de abril, de forma totalmente virtual devido à pandemia da Covid-19. Nesse evento, sob orientação do Prof. Dalvan Griebler e Dinei Rockenbach, o aluno Luan Dopke apresentou seu trabalho de pesquisa de iniciação científica.

O artigo apresentado por Luan se intitula “Avaliação de Desempenho para Banco de Dados com Genoma em Nuvem Privada” na sessão de Iniciação Científica. O estudo visa avaliar o comportamento de três bancos de dados em nuvem, sendo MySQL e PostgreSQL como banco de dados relacionais e MongoDB como banco de dados não relacional, em um ambiente de pesquisa com dados de genomas.

Para realizar a pesquisa, o autor utilizou como conjunto de dados parte do genoma humano extraído do site da NCBI, sendo ele importado nos bancos de dados para executar as consultas e monitorar o desempenho da execução de cada consulta.

Os experimentos elucidam que no ambiente proposto pelo artigo, o banco de dados PostgreSQL obteve melhor desempenho em relação aos demais, fazendo melhor uso dos recursos disponibilizados pela Nuvem Privada do LARCC. Também chegou-se à conclusão que ao alterar a quantidade de núcleos disponíveis, não houve uma melhora significativa no desempenho das consultas.

A principal contribuição deste trabalho é auxiliar pesquisadores da área de bioinformática, na escolha de banco de dados adequados para um ambiente em nuvem que trata de dados genômicos. Esta pesquisa está sendo continuada no LARCC, considerando outros tipos de bancos de dados e também configurações de ambiente.

A apresentação completa pode ser conferida abaixo: